27 марта 1941 года для укрепления Военно-воздушных сил страны по решению правительства была создана Ленинградская военно-воздушная академия Красной Армии (ЛВВА КА).
Постановление № 368-167сс под грифом «Особой важности. Совершенно секретно» «О реорганизации авиационных сил Красной Армии» от 25 февраля 1941 года предписывало Народному Комиссариату обороны передать Ленинградский институт инженеров гражданского воздушного флота (ЛИИ ГВФ) вновь созданной ЛВВА КА.
Что представляло собой учебное заведение, на базе которого была создана академия? История ЛИИ ГВФ началась в 1930 году с воздушного факультета Ленинградского института инженеров путей сообщения, учреждённого в 1809 году высочайшим манифестом императора Александра I как Институт Корпуса инженеров путей сообщения. Окончившие его выпускались инженерами с присвоением воинских званий поручиков и подпоручиков.
В 1908 году по решению Совета института здесь были организованы лекции по воздухоплаванию и авиации. Их читали военные специалисты – воздухоплаватели, в том числе командир учебного воздухоплавательного парка (с 1910 года – начальник Офицерской воздухоплавательной школы) генерал А. Кованько. Стоит особо отметить, что именно он по личному поручению военного министра Российской империи П. Ванновского в 1890 году в Красном Селе произвёл осмотр самолёта А.Ф. Можайского.
Люди, увлечённые воздухоплаванием, под руководством Н. Рынина создали студенческий кружок, небольшой воздухоплавательный музей и аэродинамическую лабораторию с камерой Эйфеля.
В 1920 году, когда ещё полыхала Гражданская война, в институте был создан факультет воздушных сообщений и Н.А. Рынин единогласно избран его деканом. Уместно вспомнить, что в это время на факультете преподавал выпускник 2-го кадетского корпуса, бывший генерал-лейтенант царской армии и начальник Николаевской инженерной академии А. Саткевич. В 1929 году он стал деканом факультета воздушных сообщений, на базе которого в 1930 году и был создан ЛИИ ГВФ.
ЛИИ ГВФ располагался на улице Плеханова, в доме 7. В 1934 году в Авиагородке под Пулковом заканчивалось строительство специального здания института, общежитий для студентов, лаборатории авиационных двигателей и жилых домов. Институт перебазировался на новое место.
К моменту реорганизации ЛИИ ГВФ был крупнейшим в Аэрофлоте учебным заведением. Институт имел в своём составе четыре факультета, 29 кафедр, две доцентуры, 25 учебных лабораторий и 15 учебных кабинетов, располагал крупной лабораторией авиадвигателей, очень хорошей для того времени аэродинамической лабораторией, 60 учебными аудиториями.
В Институте работали 138 человек профессорско-преподавательского состава. За 10 лет его сотрудниками было выполнено около 200 научно-исследовательских работ, выпущено 25 сборников Трудов института, издано 73 учебника и 85 учебных пособий. Количество инженеров, подготовленных институтом за годы существования, составило 2425 человек. Более 100 студентов участвовали в Советско-финляндской войне 1939–1940 годов в составе батальона лыжников-добровольцев. Многие из них за мужество, проявленное в боях с белофиннами, были награждены орденами и медалями.
Выпускники ЛИИ ГВФ ценились как хорошие специалисты. Они успешно и плодотворно работали на ведущих и руководящих должностях в Аэрофлоте и в других центральных учреждениях страны.
27 марта 1941 года состоялось несколько приказов Народного комиссара обороны Союза ССР Маршала Советского Союза С.К. Тимошенко по формированию ЛВВА КА.
27 марта 1941 года состоялось несколько приказов Народного комиссара обороны Союза ССР Маршала Советского Союза С.К. Тимошенко по формированию ЛВВА КА
31 марта 1941 года генерал-майор авиации А. Шарапов, назначенный начальником академии, издал Приказ № 1 по ЛВВА КА по части строевой, параграф 1 которого гласил: «Сего числа вступил в командование Академии. Основание: Приказ НКО № 787 от 27/III-с.г.».
В тот же день на первом построении академии в спортивном зале бывшего ЛИИ ГВФ личному составу были объявлены Приказ Народного комиссара обороны Союза ССР № 0800 от 27.03.1941 года об определении студентов ЛИИ ГВФ по именным спискам в кадры Красной Армии и зачислении их слушателями ЛВВА КА и Приказ № 0812 от того же 27.03.1941 года об определении в кадры Красной Армии и назначении на должности в ЛВВА КА 133 человек начальствующего состава с присвоением им воинских званий.
Начальник Главного управления ВВС Красной Армии доложил Народному комиссару обороны Маршалу С.К. Тимошенко: «На базе ИИГВФ с 1 апреля с.г. сформирована Ленинградская военно-воздушная академия на 2000 слушателей».
Заместителем начальника академии по научной и учебной работе был назначен бригинженер А. Пономарёв, заместителем начальника академии по политической части – полковой комиссар Н. Фёдоров.
1 апреля в академии начались занятия. С началом Великой Отечественной войны около 100 вольнонаёмных сотрудников академии добровольно ушли в дивизии народного ополчения. 26 июня личный состав вновь созданной академии, призванный в Красную Армию, был приведён к присяге. С 30 июня 1941 года академия перешла на учебные планы со сроком обучения два года.
К концу июля враг вплотную приблизился к Ленинграду. В начале августа 1941 года на основании директивы Генерального штаба академия была передислоцирована в город Йошкар-Олу. После победного окончания войны, в мае 1945 года, вернулась в Ленинград с дислокацией на месте нынешнего расположения.
За годы Великой Отечественной войны академию окончили 2193 человека. За выдающиеся успехи в подготовке высококвалифицированных авиационных кадров Указом Президиума Верховного Совета Союза ССР от 9 июля 1945 года академия была награждена орденом Красного Знамени.
С 1955 года академия носит имя А.Ф. Можайского.
В 1961 году академия вошла в состав созданного нового вида Вооружённых Сил – Ракетных войск стратегического назначения.
В 1981 году приказом министра обороны СССР Военный инженерный Краснознамённый институт имени А.Ф. Можайского выведен из подчинения Главнокомандующего РВСН и включён в состав Главного управления космических средств Министерства обороны СССР.
В 2015 году академия вошла в состав космических войск Воздушно-космических сил – нового вида Вооружённых Сил Российской Федерации.