Основными угрозами, которым в российском эксклаве противостоят наши пограничники, являются контрабанда и незаконная миграция.

Пограничное управление ФСБ России по Калининградской области осуществляет охрану Государственной границы Российской Федерации общей протяжённостью 648 километров 300 метров, из них на морской участок приходится 170,5 километра.
В общей сложности по периметру области рассредоточены более 20 пограничных застав, на охрану границы ежесуточно заступают свыше 180 пограничных нарядов. Самый короткий и самый западный участок сухопутной границы России протяжённостью менее 900 метров проходит по Балтийской косе – узкой полосе суши, отделяющей Калининградский залив от Балтийского моря. Общая её длина составляет 65 километров, 35 из которых принадлежат России, остальные – Польше, где коса называется Вислинской. На этом участке границы расположен радиотехнический пост «Западный». Российские пограничники, несущие здесь службу, осуществляют контроль не только за сухопутным участком границы, но и за соблюдением правил пограничного режима в акватории Балтийского моря и Калининградского залива. Нелишне отметить, что радиотехнический пост «Западный» является одним из элементов единой автоматизированной системы технического контроля за надводной обстановкой в регионе.
Общая протяжённость российско-польского участка государственной границы составляет 234 километра 710 метров, российско-литовского – 287 километров 490 метров. По всему этому периметру, а также и в самом Калининграде в настоящее время действуют 15 пунктов пропуска, 8 из которых – автомобильные, 4 – железнодорожные, один морской (Калининградский морской порт), один речной (посёлок Рыбачий) и один воздушный (аэропорт Храброво).
Самый короткий и самый западный участок сухопутной границы России протяжённостью менее 900 метров проходит по Балтийской косе
О пунктах пропуска следует сказать подробнее, поскольку основными угрозами, которым противостоят сотрудники Пограничного управления ФСБ России по Калининградской области, являются контрабанда (главным образом янтаря-сырца и подакцизных товаров) и незаконная миграция (в силу своего территориально-географического положения область привлекает мигрантов в качестве транзитного маршрута в страны Евросоюза).
Самым современным и крупным в Калининградской области пунктом пропуска через госграницу является автомобильный пункт пропуска в Мамоново (Гжехотка), введённый в эксплуатацию в 2010 году. Он оборудован 24 автомобильными полосами и способен «переварить» за сутки до 2600 легковых, 1250 грузовых автомашин и 150 автобусов. В распоряжении пограничников – современные системы светофорного регулирования и теленаблюдения, стационарная таможенная система по обнаружению радиоактивных материалов, рентгенотелевизионная досмотровая установка, способная «просвечивать» грузы любого габарита. Активно используются и традиционные помощники стражей границы – служебные собаки.
Об интенсивности работы на этих важных участках выразительно говорят цифры. Только в 2018 году пункт пропуска Мамоново пересекли свыше 1 100 000 человек. Всего же в пунктах пропуска, подконтрольных региональному пограничному управлению, в минувшем году было зафиксировано более 2,5 миллиона проездов транспортных средств (свыше 5,6 млн человек), при этом удалось выявить более 350 нарушителей режима государственной границы и свыше 2000 лиц с недействительными документами.
С контрабандой товаров, осуществляемой водным путём, незаконным пересечением госграницы на различных типах судов и незаконной добычей морских биоресурсов успешно борются подразделения береговой охраны, зона ответственности которой распространяется на акватории Балтийского моря, Калининградского и Куршского заливов, Виштынецкого озера и реки Неман. Береговая охрана оснащена современными пограничными сторожевыми кораблями и быстроходными катерами, в том числе катерами на воздушной подушке.
Особенности территориально-географического положения Калининградской области отражаются и на специфике охраны водных границ, прежде всего морских. За вычетом России все девять примыкающих к Балтийскому морю и его проливам государств являются членами Евросоюза, семь из них входят в НАТО. Акватория вод, где несёт службу береговая охрана, на юге и западе граничит с водами Польши, на севере и востоке – с водами Литвы, на северо-западе – с водами исключительной экономической зоны Швеции.
На относительно небольшой площади вод рядом с Калининградской областью ведётся активная добыча морских биоресурсов и нефти на континентальном шельфе РФ, осуществляется активное судоходство, в прибрежной зоне много яхт и катеров. Комплексное применение сил и средств подразделений береговой охраны, а также единой автоматизированной системы технического контроля за надводной обстановкой позволяет надёжно обеспечивать пограничную безопасность государства также и на Балтийском море.
